Każda jednostka zarejestrowana w systemie EdPlan™ otrzymuje dostęp do panelu logowania oraz listę identyfikatorów i haseł dostępu dla upoważnionych pracowników danej organizacji. Hasła zmieniane są z częstotliwością nie mniejszą niż 30 dni, a konieczność zmiany hasła wymuszana jest przez system. Połączenie z systemem EdPlan™ jest realizowane za pomocą protokołu SSL (połączenie szyfrowane), co gwarantuje najwyższy stopień bezpieczeństwa pracy z aplikacją internetową. Selektywność dostępu do danych wrażliwych uczniów zawartych w systemie EdPlan™ jest zapewniona poprzez złożoną strukturę uprawnień odpowiadającą rzeczywistym rolom pełnionym przez poszczególnych użytkowników systemu w swoich organizacjach.

System spełnia wszystkie wymogi Generalnego Inspektora Ochrony Danych Osobowych (GIODO), zapisane w Ustawie z dnia 29 sierpnia 1997 r. o ochronie danych osobowych oraz Rozporządzeniu Ministra Spraw Wewnętrznych i Administracjiz dnia 29 kwietnia 2004 r. w sprawie dokumentacji, przetwarzania danych osobowych oraz warunków technicznych i organizacyjnych, jakim powinny odpowiadać urządzenia i systemy informatyczne służące do przetwarzania danych osobowych.